琴峰書院在饒平縣三饒鎮(zhèn)琴峰山東南麓，因其山形似琴臺，故名。曾是饒平縣的最高學府，現(xiàn)位于饒平縣三饒鎮(zhèn)中心小學范圍內(nèi)。清乾隆二十年（1755）以明嘉靖初年創(chuàng)辦的三饒社學易名在城書院，翌年，又易名為三饒書院，清光緒三年（1877）定名為琴峰書院。

琴峰書院建于清乾隆元年門（1736年），座西北向東南，面闊16.6米，進深24.8米，占地近2600多平方米，建筑面積約1200平方米。依山而筑，前低后高，前廳與兩旁廂房是2層木結(jié)構(gòu)樓房，連成凹字形。兩廊上下各有廂房10間，為生員宿舍，中間是天井，從天井沿兩側(cè)石階可拾級登上后廳講堂。前廳樓上題名“雨化樓”，取“春風化雨”之意。院左側(cè)建“義舉詞”，置曾于此任教的舉人名牌；右側(cè)建“先賢詞”，塑立關(guān)云長、岳飛等神像。門匾鐫陽刻篆書“琴峰書院”，前埕靠小學大門右側(cè)內(nèi)墻立有《饒平縣知縣正堂……》碑、《潮州府饒平縣為義學之經(jīng)費……》碑和《饒平縣為詳請酌定師生膏火……》碑等三通碑刻，年代不詳，部分字跡模糊難辯。

迨至清末廢科舉，琴峰書院改為饒平縣立高等學堂。解放后改為三饒鎮(zhèn)小學。

1988年10月被列饒平縣第二批重點文物保護單位。